Jottacloud synkroniseringsmappe (også omtalt som 'synk-mappe') er en unik mappe som automatisk synkroniserer alt innhold til alle dine datamaskiner som også har Jottacloud installert.

På din datamaskin vil den ligge i din personlige mappe, med et Jottacloud ikon på seg. Der er også å finne i favorittmenyen på venstreside i filutforskeren:
​

Mapper eller filer du ønsker å synkronisere kan flyttes, kopieres eller dras inn i mappen.
​